FSC将在森林经营（FM）认证中率先推行电子审计报告系统，目前全球各地的审核员已经可以开始了解和学习这套系统。2021年1月起所有的森林经营认证审核将必须使用该系统，到2022年1月全部完成转换。
电子报告系统的推出旨在规范所有认证机构的审核报告，更好地管理和分析审核信息。系统还将允许FSC通过分析审核数据，更容易发现审核的规律、影响和风险程度，以便更好地评估和改善FSC体系。审核员填写报告后，系统将自动生成公开总结报告，从而减少审核员的工作量，提高公开数据的质量。
目前这套电子报告系统还仅限于FM认证，下一步FSC还将规划产销监管链（CoC）认证报告的电子化。
为了确保简便易用，报告采用了MS Word模板，只要加装专用插件，就可以实现报告信息和FSC数据库的自动同步。公众仍可以通过FSC国际的公开数据库获取公开总结报告，报告披露的数据范围和以前没有变化，但数据形式会更统一、更准确。
在正式推出前FSC在部分认证机构中进行了试点，目前提供9种语言的报告模板，包括中文版。未来如有需求还可增加更多语言的版本。FSC电子报告系统的资源包已可下载，包括报告模板、插件、联合认证成员清单和农药清单，同时利益相关方还可通过视频和常见问题解答板块了解更多详细信息。